Nanopore: Transcriptoma

Desvende o mundo dos RNA com o sequenciamento por nanoporos e aprenda a analisar isoformas, transcritos de splicing alternativo e padrões únicos de bases modificadas. Com agilidade e precisão, explore a expressão diferencial dessas moléculas, seja por RNA direto ou cDNA.

RESUMO DO WEBINAR

Transcriptoma por nanoporo é uma alternativa rápida e acurada para identificar diferentes isoformas, transcritos de splicing alternativo e comprimento de cauda poli-A. Vamos demonstrar o passo-a-passo de como obter e analisar dados de transcritos completos.

Renata Carmona e Ferreira, PhD, é Field Application Scientist na Interprise, com foco em Sequenciamento pela tecnologia da Oxford Nanopore Technologies. Sua pesquisa tem sido voltada para a dinâmica evolutiva e os mecanismos moleculares que controlam a expressão gênica em eucariotos, com destaque para modelos matemáticos de expressão gênica, a recombinação intragênica em Trypanosoma cruzi, e a genômica de tripanossomatídeos. Também contribuiu para estudos sobre o papel da HDAC1 no desenvolvimento da retina de camundongos e desenvolveu métodos para a identificação precisa de espécies do complexo Candida parapsilosis.

Gabriel Gomide é Bioinformata na Interprise Brasil, com experiência em processamento e análise de dados de sequenciamento (Oxford Nanopore Technology), otimização de genotipagem e desenvolvimento de pipelines de análise. Anteriormente, atuou como Bioinformata em P&D, onde contribuiu para a internalização de testes de microarray, otimizando a qualidade e reduzindo custos e prazos de entrega. Com experiência em biologia molecular, design experimental e automação de processos, com foco em bioinformática e biologia computacional, iniciou sua trajetória acadêmica e profissional com projetos de pesquisa voltados para vacinas e nanotecnologia, incluindo a participação em estudos sobre vacinas contra a meningite e o Zika vírus.

TÓPICOS IMPORTANTES

Diferenças entre o sequenciamento de RNA direto e cDNA.
Análise de expressão diferencial.
Montagem e anotação de dados de sequenciamento de cDNA e RNA direto.

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